Обнаружение вируса трансмиссивного гастроэнтерита (ТГС) и дифференциация от респираторного коронавируса свиней (РКВС) проводится с использованием ОТ-ПЦР. В результате реакции РНК преобразуется в кДНК и затем амплифицируется. При этом концентрация синтезированного фрагмента в исследуемой пробе увеличивается в миллионы раз, что позволяет учитывать результаты анализа с помощью электрофореза в агарозном геле.
РКВС является делеционным мутантом вируса ТГС. Тест-система устроена таким образом, что после проведения «гнездовой» ПЦР на матрице вируса ТГС образуется фрагмент размером 874 п.н., тогда как на матрице РКВС образуются короткие фрагменты размером 192-253 п.н. (в зависимости от штамма).
Места посадки праймеров являются консервативными для вирусов ТГС и РКВС, следовательно, условия амплификации также будут одинаковые. С помощью размеров ПЦР-фрагмента происходит дифференцирование двух вирусов.
|